RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326431.3

TMIE-201, Transcript of transmembrane inner ear, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIE, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIE-201ENST00000326431 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP30.55■■■□□ 2.48
TMIE-201ENST00000326431 MRC1P22897 1456 aa30.55■■■□□ 2.48
TMIE-201ENST00000326431 DCAF5Q96JK2 942 aa30.54■■■□□ 2.48
TMIE-201ENST00000326431 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa30.54■■■□□ 2.48
TMIE-201ENST00000326431 LRP6O75581 1613 aa30.53■■■□□ 2.48
TMIE-201ENST00000326431 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP30.53■■■□□ 2.48
TMIE-201ENST00000326431 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa30.53■■■□□ 2.48
TMIE-201ENST00000326431 RLBP1P12271 317 aa30.52■■■□□ 2.48
TMIE-201ENST00000326431 SLC52A2Q9HAB3 445 aa30.52■■■□□ 2.48
TMIE-201ENST00000326431 KCNQ3O43525 872 aa30.51■■■□□ 2.47
TMIE-201ENST00000326431 TRIM27P14373 513 aa30.5■■■□□ 2.47
TMIE-201ENST00000326431 CLUAP1Q96AJ1 413 aa30.5■■■□□ 2.47
TMIE-201ENST00000326431 CACNA1FO60840 1977 aa30.5■■■□□ 2.47
TMIE-201ENST00000326431 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
TMIE-201ENST00000326431 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa30.5■■■□□ 2.47
TMIE-201ENST00000326431 C8orf37Q96NL8 207 aa30.49■■■□□ 2.47
TMIE-201ENST00000326431 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa30.49■■■□□ 2.47
TMIE-201ENST00000326431 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
TMIE-201ENST00000326431 COG6Q9Y2V7 657 aa30.48■■■□□ 2.47
TMIE-201ENST00000326431 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
TMIE-201ENST00000326431 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
TMIE-201ENST00000326431 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa30.47■■■□□ 2.47
TMIE-201ENST00000326431 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
TMIE-201ENST00000326431 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa30.47■■■□□ 2.47
TMIE-201ENST00000326431 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
TMIE-201ENST00000326431 CCDC136Q96JN2 1154 aa30.46■■■□□ 2.47
TMIE-201ENST00000326431 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
TMIE-201ENST00000326431 NGLY1Q96IV0 654 aa30.45■■■□□ 2.47
TMIE-201ENST00000326431 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa30.45■■■□□ 2.46
TMIE-201ENST00000326431 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa30.45■■■□□ 2.46
TMIE-201ENST00000326431 MS4A1P11836 297 aa30.45■■■□□ 2.46
TMIE-201ENST00000326431 BCL9LQ86UU0 1499 aa30.44■■■□□ 2.46
TMIE-201ENST00000326431 UNC5CLQ8IV45 518 aa30.44■■■□□ 2.46
TMIE-201ENST00000326431 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
TMIE-201ENST00000326431 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
TMIE-201ENST00000326431 ARHGAP45Q92619 1136 aa30.43■■■□□ 2.46
TMIE-201ENST00000326431 CABP4P57796 275 aa30.41■■■□□ 2.46
TMIE-201ENST00000326431 SLC39A6Q13433 755 aa30.4■■■□□ 2.46
TMIE-201ENST00000326431 TNS2Q63HR2 1409 aa30.4■■■□□ 2.46
TMIE-201ENST00000326431 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
TMIE-201ENST00000326431 HEG1Q9ULI3 1381 aa30.4■■■□□ 2.46
TMIE-201ENST00000326431 ZNF790Q6PG37 636 aa30.4■■■□□ 2.46
TMIE-201ENST00000326431 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
TMIE-201ENST00000326431 C5P01031 1676 aa30.39■■■□□ 2.46
TMIE-201ENST00000326431 SLC4A2P04920 1241 aa30.39■■■□□ 2.46
TMIE-201ENST00000326431 HOXB7P09629 217 aa30.39■■■□□ 2.46
TMIE-201ENST00000326431 CCDC30Q5VVM6 783 aa30.39■■■□□ 2.46
TMIE-201ENST00000326431 NECTIN2Q92692 538 aa30.39■■■□□ 2.46
TMIE-201ENST00000326431 ITGB4P16144 1822 aa30.39■■■□□ 2.46
TMIE-201ENST00000326431 ERVV-2B6SEH9 535 aa30.38■■■□□ 2.45
TMIE-201ENST00000326431 MVPQ14764 893 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
TMIE-201ENST00000326431 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
TMIE-201ENST00000326431 PAPPAQ13219 1627 aa30.37■■■□□ 2.45
TMIE-201ENST00000326431 EXOC5O00471 708 aa30.37■■■□□ 2.45
TMIE-201ENST00000326431 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa30.37■■■□□ 2.45
TMIE-201ENST00000326431 STK31Q9BXU1 1019 aa30.37■■■□□ 2.45
TMIE-201ENST00000326431 TMEM57Q8N5G2 664 aa30.36■■■□□ 2.45
TMIE-201ENST00000326431 UBR2Q8IWV8 1755 aa30.35■■■□□ 2.45
TMIE-201ENST00000326431 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
TMIE-201ENST00000326431 VPS72Q15906 364 aa30.35■■■□□ 2.45
TMIE-201ENST00000326431 BARGINQ6ZT62 677 aa30.34■■■□□ 2.45
TMIE-201ENST00000326431 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
TMIE-201ENST00000326431 KAT6BQ8WYB5 2073 aa30.34■■■□□ 2.45
TMIE-201ENST00000326431 RGS12O14924 1447 aa30.34■■■□□ 2.45
TMIE-201ENST00000326431 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
TMIE-201ENST00000326431 G2E3Q7L622 706 aa30.33■■■□□ 2.45
TMIE-201ENST00000326431 ABCC4O15439 1325 aa30.33■■■□□ 2.45
TMIE-201ENST00000326431 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
TMIE-201ENST00000326431 ITPRIPQ8IWB1 547 aa30.33■■■□□ 2.45
TMIE-201ENST00000326431 USP21Q9UK80 565 aa30.33■■■□□ 2.45
TMIE-201ENST00000326431 PTPRCP08575 1304 aa30.33■■■□□ 2.45
TMIE-201ENST00000326431 GLI3P10071 1580 aa30.32■■■□□ 2.44
TMIE-201ENST00000326431 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa30.31■■■□□ 2.44
TMIE-201ENST00000326431 DDB1Q16531 1140 aa30.31■■■□□ 2.44
TMIE-201ENST00000326431 TTC5Q8N0Z6 440 aa30.31■■■□□ 2.44
TMIE-201ENST00000326431 DOT1LQ8TEK3 1739 aa30.3■■■□□ 2.44
TMIE-201ENST00000326431 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
TMIE-201ENST00000326431 DDX19BQ9UMR2 479 aa30.29■■■□□ 2.44
TMIE-201ENST00000326431 CHMP4AQ9BY43 222 aa30.28■■■□□ 2.44
TMIE-201ENST00000326431 LAMB4A4D0S4 1761 aa30.28■■■□□ 2.44
TMIE-201ENST00000326431 AAMPQ13685 434 aa30.27■■■□□ 2.44
TMIE-201ENST00000326431 CHPF2Q9P2E5 772 aa30.26■■■□□ 2.44
TMIE-201ENST00000326431 FLIIQ13045 1269 aa30.26■■■□□ 2.43
TMIE-201ENST00000326431 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
TMIE-201ENST00000326431 FMNL2Q96PY5 1086 aa30.26■■■□□ 2.43
TMIE-201ENST00000326431 TMOD3Q9NYL9 352 aa30.26■■■□□ 2.43
TMIE-201ENST00000326431 KCPQ6ZWJ8 1503 aa30.26■■■□□ 2.43
TMIE-201ENST00000326431 AFF2P51816 1311 aa30.25■■■□□ 2.43
TMIE-201ENST00000326431 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
TMIE-201ENST00000326431 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
TMIE-201ENST00000326431 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
TMIE-201ENST00000326431 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa30.21■■■□□ 2.43
TMIE-201ENST00000326431 ANXA1P04083 346 aa30.21■■■□□ 2.43
TMIE-201ENST00000326431 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
TMIE-201ENST00000326431 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
TMIE-201ENST00000326431 PIGBQ92521 554 aa30.21■■■□□ 2.43
TMIE-201ENST00000326431 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
TMIE-201ENST00000326431 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
TMIE-201ENST00000326431 F6X3S4 739 aa30.19■■■□□ 2.42
TMIE-201ENST00000326431 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.4 ms