RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317378.5

TRAPPC5-201, Transcript of trafficking protein particle complex 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC5, Length 790 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5-201ENST00000317378 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC5-201ENST00000317378 ATP6V1AP38606 617 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC5-201ENST00000317378 CD2APQ9Y5K6 639 aa27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC5-201ENST00000317378 IL13P35225 146 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC5-201ENST00000317378 AEBP1Q8IUX7 1158 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC5-201ENST00000317378 KDRP35968 1356 aa27.84■■■□□ 2.05
TRAPPC5-201ENST00000317378 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC5-201ENST00000317378 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
TRAPPC5-201ENST00000317378 SMIM5Q71RC9 77 aa27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC5-201ENST00000317378 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
TRAPPC5-201ENST00000317378 SLC4A9Q96Q91 983 aa27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC5-201ENST00000317378 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
TRAPPC5-201ENST00000317378 PHF14O94880 888 aa27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC5-201ENST00000317378 SULT6B1Q6IMI4 303 aa27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC5-201ENST00000317378 ZNF831Q5JPB2 1677 aa27.8■■■□□ 2.04
TRAPPC5-201ENST00000317378 GNPATO15228 680 aa27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC5-201ENST00000317378 GRIN3BO60391 1043 aa27.78■■■□□ 2.04
TRAPPC5-201ENST00000317378 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.78■■■□□ 2.048e-7■■■■□ 21.7
TRAPPC5-201ENST00000317378 MTHFSP49914 203 aa27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC5-201ENST00000317378 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
TRAPPC5-201ENST00000317378 CABP4P57796 275 aa27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC5-201ENST00000317378 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
TRAPPC5-201ENST00000317378 C1orf141Q5JVX7 400 aa27.75■■■□□ 2.03
TRAPPC5-201ENST00000317378 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
TRAPPC5-201ENST00000317378 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa27.72■■■□□ 2.03
TRAPPC5-201ENST00000317378 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC5-201ENST00000317378 TRAPPC3LQ5T215 181 aa27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC5-201ENST00000317378 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
TRAPPC5-201ENST00000317378 ADRA2BP18089 450 aa27.7■■■□□ 2.02
TRAPPC5-201ENST00000317378 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC5-201ENST00000317378 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC5-201ENST00000317378 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
TRAPPC5-201ENST00000317378 RPS6KA4O75676 772 aa27.68■■■□□ 2.02
TRAPPC5-201ENST00000317378 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
TRAPPC5-201ENST00000317378 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC5-201ENST00000317378 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC5-201ENST00000317378 NLGN1Q8N2Q7 840 aa27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC5-201ENST00000317378 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
TRAPPC5-201ENST00000317378 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
TRAPPC5-201ENST00000317378 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC5-201ENST00000317378 MMP10P09238 476 aa27.64■■■□□ 2.02
TRAPPC5-201ENST00000317378 HMOX1P09601 288 aa27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC5-201ENST00000317378 LGR6Q9HBX8 967 aa27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC5-201ENST00000317378 SLC52A2Q9HAB3 445 aa27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC5-201ENST00000317378 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC5-201ENST00000317378 GYS1P13807 737 aa27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC5-201ENST00000317378 RNMTO43148 476 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC5-201ENST00000317378 RFC4P35249 363 aa27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC5-201ENST00000317378 CRKLP46109 303 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC5-201ENST00000317378 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC5-201ENST00000317378 MRC1P22897 1456 aa27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC5-201ENST00000317378 C1QTNF8P60827 252 aa27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC5-201ENST00000317378 KIF13BQ9NQT8 1826 aa27.57■■■□□ 2
TRAPPC5-201ENST00000317378 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
TRAPPC5-201ENST00000317378 TJP1Q07157 1748 aa27.57■■■□□ 2
TRAPPC5-201ENST00000317378 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa27.56■■■□□ 2
TRAPPC5-201ENST00000317378 TGFB2P61812 414 aa27.56■■■□□ 2
TRAPPC5-201ENST00000317378 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
TRAPPC5-201ENST00000317378 C10orf71Q711Q0 1435 aa27.54■■■□□ 2
TRAPPC5-201ENST00000317378 C4AP0C0L4 1744 aa27.53■■■□□ 2
TRAPPC5-201ENST00000317378 PXDNLA1KZ92 1463 aa27.53■■■□□ 2
TRAPPC5-201ENST00000317378 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa27.53■■■□□ 2
TRAPPC5-201ENST00000317378 DNAJC10Q8IXB1 793 aa27.52■■■□□ 2
TRAPPC5-201ENST00000317378 ADCY9O60503 1353 aa27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC5-201ENST00000317378 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC5-201ENST00000317378 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC5-201ENST00000317378 SLC39A6Q13433 755 aa27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC5-201ENST00000317378 CCDC87Q9NVE4 849 aa27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC5-201ENST00000317378 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC5-201ENST00000317378 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
TRAPPC5-201ENST00000317378 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC5-201ENST00000317378 WWC3Q9ULE0 1092 aa27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC5-201ENST00000317378 ATP10DQ9P241 1426 aa27.5■■□□□ 1.99
TRAPPC5-201ENST00000317378 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC5-201ENST00000317378 VSIG10Q8N0Z9 540 aa27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC5-201ENST00000317378 KCPQ6ZWJ8 1503 aa27.49■■□□□ 1.99
TRAPPC5-201ENST00000317378 FKBP8Q14318 412 aa27.48■■□□□ 1.99
TRAPPC5-201ENST00000317378 A0A0G2JLW4 131 aa27.47■■□□□ 1.99
TRAPPC5-201ENST00000317378 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC5-201ENST00000317378 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
TRAPPC5-201ENST00000317378 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.99
TRAPPC5-201ENST00000317378 DPEP1P16444 411 aa27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC5-201ENST00000317378 TM4SF1P30408 202 aa27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC5-201ENST00000317378 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC5-201ENST00000317378 IL17REQ8NFR9 667 aa27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC5-201ENST00000317378 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.45■■□□□ 1.98
TRAPPC5-201ENST00000317378 KCNA3P22001 575 aa27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC5-201ENST00000317378 DDR1Q08345 913 aa27.44■■□□□ 1.98
TRAPPC5-201ENST00000317378 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.43■■□□□ 1.98
TRAPPC5-201ENST00000317378 UBR2Q8IWV8 1755 aa27.42■■□□□ 1.98
TRAPPC5-201ENST00000317378 ZPR1O75312 459 aa27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC5-201ENST00000317378 NARFQ9UHQ1 456 aa27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC5-201ENST00000317378 BCS1LQ9Y276 419 aa27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC5-201ENST00000317378 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa27.41■■□□□ 1.98
TRAPPC5-201ENST00000317378 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC5-201ENST00000317378 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC5-201ENST00000317378 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC5-201ENST00000317378 CFAP53Q96M91 514 aa27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC5-201ENST00000317378 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
TRAPPC5-201ENST00000317378 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms