RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 KDRP35968 1356 aa27.37■■□□□ 1.97
TTC9B-201ENST00000311308 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.37■■□□□ 1.97
TTC9B-201ENST00000311308 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
TTC9B-201ENST00000311308 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
TTC9B-201ENST00000311308 LINC00116Q8NCU8 138 aa27.36■■□□□ 1.97
TTC9B-201ENST00000311308 TAF1LQ8IZX4 1826 aa27.35■■□□□ 1.97
TTC9B-201ENST00000311308 GNPATO15228 680 aa27.34■■□□□ 1.97
TTC9B-201ENST00000311308 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
TTC9B-201ENST00000311308 UTRNP46939 3433 aa27.34■■□□□ 1.97
TTC9B-201ENST00000311308 ITPK1Q13572 414 aa27.33■■□□□ 1.97
TTC9B-201ENST00000311308 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
TTC9B-201ENST00000311308 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.32■■□□□ 1.96
TTC9B-201ENST00000311308 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
TTC9B-201ENST00000311308 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
TTC9B-201ENST00000311308 NLGN2Q8NFZ4 835 aa27.31■■□□□ 1.96
TTC9B-201ENST00000311308 AKAP4Q5JQC9 854 aa27.3■■□□□ 1.96
TTC9B-201ENST00000311308 CD2APQ9Y5K6 639 aa27.3■■□□□ 1.96
TTC9B-201ENST00000311308 AMIGO3Q86WK7 504 aa27.29■■□□□ 1.96
TTC9B-201ENST00000311308 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
TTC9B-201ENST00000311308 HMOX1P09601 288 aa27.27■■□□□ 1.96
TTC9B-201ENST00000311308 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
TTC9B-201ENST00000311308 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa27.27■■□□□ 1.96
TTC9B-201ENST00000311308 TRAPPC3LQ5T215 181 aa27.26■■□□□ 1.95
TTC9B-201ENST00000311308 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
TTC9B-201ENST00000311308 GRIN3BO60391 1043 aa27.25■■□□□ 1.95
TTC9B-201ENST00000311308 SMIM5Q71RC9 77 aa27.25■■□□□ 1.95
TTC9B-201ENST00000311308 UBR3Q6ZT12 1888 aa27.25■■□□□ 1.95
TTC9B-201ENST00000311308 ADRA2BP18089 450 aa27.24■■□□□ 1.95
TTC9B-201ENST00000311308 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa27.23■■□□□ 1.95
TTC9B-201ENST00000311308 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
TTC9B-201ENST00000311308 SLC4A9Q96Q91 983 aa27.23■■□□□ 1.95
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF831Q5JPB2 1677 aa27.21■■□□□ 1.95
TTC9B-201ENST00000311308 SLC52A2Q9HAB3 445 aa27.2■■□□□ 1.94
TTC9B-201ENST00000311308 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
TTC9B-201ENST00000311308 RPS6KA4O75676 772 aa27.19■■□□□ 1.94
TTC9B-201ENST00000311308 NLGN1Q8N2Q7 840 aa27.19■■□□□ 1.94
TTC9B-201ENST00000311308 RFC4P35249 363 aa27.18■■□□□ 1.94
TTC9B-201ENST00000311308 CFAP53Q96M91 514 aa27.18■■□□□ 1.94
TTC9B-201ENST00000311308 RNMTO43148 476 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
TTC9B-201ENST00000311308 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
TTC9B-201ENST00000311308 MMP10P09238 476 aa27.16■■□□□ 1.94
TTC9B-201ENST00000311308 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
TTC9B-201ENST00000311308 LGR6Q9HBX8 967 aa27.16■■□□□ 1.94
TTC9B-201ENST00000311308 CHD4Q14839 1912 aa27.16■■□□□ 1.94
TTC9B-201ENST00000311308 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.15■■□□□ 1.94
TTC9B-201ENST00000311308 CRKLP46109 303 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
TTC9B-201ENST00000311308 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
TTC9B-201ENST00000311308 GAS2L2Q8NHY3 880 aa27.13■■□□□ 1.93
TTC9B-201ENST00000311308 NUDCQ9Y266 331 aa27.12■■□□□ 1.93
TTC9B-201ENST00000311308 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
TTC9B-201ENST00000311308 SCN11AQ9UI33 1791 aa27.11■■□□□ 1.93
TTC9B-201ENST00000311308 MRC1P22897 1456 aa27.1■■□□□ 1.93
TTC9B-201ENST00000311308 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
TTC9B-201ENST00000311308 GYS1P13807 737 aa27.09■■□□□ 1.93
TTC9B-201ENST00000311308 PARP3Q9Y6F1 533 aa27.09■■□□□ 1.93
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC87Q9NVE4 849 aa27.08■■□□□ 1.93
TTC9B-201ENST00000311308 GNAT3A8MTJ3 354 aa27.07■■□□□ 1.92
TTC9B-201ENST00000311308 SLC39A6Q13433 755 aa27.07■■□□□ 1.92
TTC9B-201ENST00000311308 DNAJC10Q8IXB1 793 aa27.07■■□□□ 1.92
TTC9B-201ENST00000311308 TTC5Q8N0Z6 440 aa27.07■■□□□ 1.92
TTC9B-201ENST00000311308 TEFQ10587 303 aa27.06■■□□□ 1.92
TTC9B-201ENST00000311308 TGFB2P61812 414 aa27.05■■□□□ 1.92
TTC9B-201ENST00000311308 VSIG10Q8N0Z9 540 aa27.05■■□□□ 1.92
TTC9B-201ENST00000311308 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
TTC9B-201ENST00000311308 ZPR1O75312 459 aa27.03■■□□□ 1.92
TTC9B-201ENST00000311308 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
TTC9B-201ENST00000311308 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
TTC9B-201ENST00000311308 PPP2R1AP30153 589 aa27.02■■□□□ 1.92
TTC9B-201ENST00000311308 PRKAR2BP31323 418 aa27.02■■□□□ 1.92
TTC9B-201ENST00000311308 WWC3Q9ULE0 1092 aa27.02■■□□□ 1.92
TTC9B-201ENST00000311308 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
TTC9B-201ENST00000311308 TJP1Q07157 1748 aa27.01■■□□□ 1.91
TTC9B-201ENST00000311308 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
TTC9B-201ENST00000311308 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
TTC9B-201ENST00000311308 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27■■□□□ 1.91
TTC9B-201ENST00000311308 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
TTC9B-201ENST00000311308 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa27■■□□□ 1.91
TTC9B-201ENST00000311308 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.99■■□□□ 1.91
TTC9B-201ENST00000311308 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
TTC9B-201ENST00000311308 STARD3NLO95772 234 aa26.99■■□□□ 1.91
TTC9B-201ENST00000311308 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.99■■□□□ 1.91
TTC9B-201ENST00000311308 FKBP8Q14318 412 aa26.98■■□□□ 1.91
TTC9B-201ENST00000311308 IL17REQ8NFR9 667 aa26.98■■□□□ 1.91
TTC9B-201ENST00000311308 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.98■■□□□ 1.91
TTC9B-201ENST00000311308 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
TTC9B-201ENST00000311308 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
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TTC9B-201ENST00000311308 ZNF790Q6PG37 636 aa26.96■■□□□ 1.91
TTC9B-201ENST00000311308 C4AP0C0L4 1744 aa26.96■■□□□ 1.91
TTC9B-201ENST00000311308 A0A0G2JLW4 131 aa26.95■■□□□ 1.9
TTC9B-201ENST00000311308 FCHSD2O94868 740 aa26.95■■□□□ 1.9
TTC9B-201ENST00000311308 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
TTC9B-201ENST00000311308 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.95■■□□□ 1.9
TTC9B-201ENST00000311308 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.95■■□□□ 1.9
TTC9B-201ENST00000311308 COL15A1P39059 1388 aa26.95■■□□□ 1.9
TTC9B-201ENST00000311308 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.94■■□□□ 1.9
TTC9B-201ENST00000311308 NARFQ9UHQ1 456 aa26.94■■□□□ 1.9
TTC9B-201ENST00000311308 BCS1LQ9Y276 419 aa26.94■■□□□ 1.9
TTC9B-201ENST00000311308 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.93■■□□□ 1.9
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