RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
SPNS1-201ENST00000311008 APBB1O00213 710 aa24.1■■□□□ 1.45
SPNS1-201ENST00000311008 ATP8B2P98198 1209 aa24.1■■□□□ 1.45
SPNS1-201ENST00000311008 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SPNS1-201ENST00000311008 PDE1AP54750 535 aa24.09■■□□□ 1.45
SPNS1-201ENST00000311008 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SPNS1-201ENST00000311008 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SPNS1-201ENST00000311008 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.09■■□□□ 1.45
SPNS1-201ENST00000311008 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SPNS1-201ENST00000311008 LTN1O94822 1766 aa24.08■■□□□ 1.45
SPNS1-201ENST00000311008 NFAT5O94916 1531 aa24.08■■□□□ 1.45
SPNS1-201ENST00000311008 HOXB7P09629 217 aa24.08■■□□□ 1.45
SPNS1-201ENST00000311008 LRRCC1Q9C099 1032 aa24.08■■□□□ 1.45
SPNS1-201ENST00000311008 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.08■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa24.07■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 ERC2O15083 957 aa24.07■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 PSME1Q06323 249 aa24.06■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.06■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 FSD2A1L4K1 749 aa24.05■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.05■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 SALL3Q9BXA9 1300 aa24.04■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 ST18O60284 1047 aa24.03■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 CLEC17AQ6ZS10 378 aa24.03■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.03■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 NECTIN2Q92692 538 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 NBPF4Q96M43 638 aa24.02■■□□□ 1.44
SPNS1-201ENST00000311008 USP44Q9H0E7 712 aa24.01■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 MX1P20591 662 aa24■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 STAP2Q9UGK3 403 aa24■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 AOX1Q06278 1338 aa24■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 GOLGA6L22H0YM25 854 aa24■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 AMOTQ4VCS5 1084 aa24■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 AKAP4Q5JQC9 854 aa24■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 NUCB2P80303 420 aa23.99■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 RAB11FIP3O75154 756 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 SSH3Q8TE77 659 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 FOXD4L1Q9NU39 408 aa23.98■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 NCAPD2Q15021 1401 aa23.96■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.96■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.96■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.96■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 MRE11P49959 708 aa23.96■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 TEFQ10587 303 aa23.96■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SPNS1-201ENST00000311008 MCCP23508 829 aa23.95■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.95■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23.94■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 LGR6Q9HBX8 967 aa23.94■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP23.94■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 SLIT3O75094 1523 aa23.94■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 MCM2P49736 904 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 POLA2Q14181 598 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGEF25Q86VW2 580 aa23.93■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.92■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 BTBD11A6QL63 1104 aa23.92■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 GCP02774 474 aa23.92■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 SSFA2P28290 1259 aa23.92■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 ANAPC15P60006 121 aa23.92■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.92■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.91■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 CHMLP26374 656 aa23.91■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 BEND3Q5T5X7 828 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.9■■□□□ 1.42
SPNS1-201ENST00000311008 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 HDAC5Q9UQL6 1122 aa23.89■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.89■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.88■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 IL17RAQ96F46 866 aa23.88■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 RILPL2Q969X0 211 aa23.88■■□□□ 1.41
SPNS1-201ENST00000311008 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
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