RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306026.5

USP19-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, humanhuman

TSL 2

Gene USP19, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19-201ENST00000306026 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
USP19-201ENST00000306026 KIF16BQ96L93 1317 aa25.1■■□□□ 1.61
USP19-201ENST00000306026 EXOC5O00471 708 aa25.1■■□□□ 1.61
USP19-201ENST00000306026 PDE3AQ14432 1141 aa25.09■■□□□ 1.61
USP19-201ENST00000306026 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.09■■□□□ 1.61
USP19-201ENST00000306026 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
USP19-201ENST00000306026 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
USP19-201ENST00000306026 CABP4P57796 275 aa25.08■■□□□ 1.61
USP19-201ENST00000306026 VPS72Q15906 364 aa25.08■■□□□ 1.61
USP19-201ENST00000306026 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.08■■□□□ 1.61
USP19-201ENST00000306026 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.08■■□□□ 1.61
USP19-201ENST00000306026 USP21Q9UK80 565 aa25.08■■□□□ 1.61
USP19-201ENST00000306026 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.08■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 BARGINQ6ZT62 677 aa25.07■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.07■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 CRBNQ96SW2 442 aa25.06■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.06■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.06■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 KCNQ3O43525 872 aa25.06■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 MS4A1P11836 297 aa25.05■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 MRC1P22897 1456 aa25.05■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 DDB1Q16531 1140 aa25.04■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 TNS2Q63HR2 1409 aa25.03■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 HOXB7P09629 217 aa25.02■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 ZNF790Q6PG37 636 aa25.02■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.02■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.02■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.02■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 PANK1Q8TE04 598 aa25.02■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.02■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.02■■□□□ 1.6
USP19-201ENST00000306026 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.01■■□□□ 1.59
USP19-201ENST00000306026 STK31Q9BXU1 1019 aa25.01■■□□□ 1.59
USP19-201ENST00000306026 AFF2P51816 1311 aa25.01■■□□□ 1.59
USP19-201ENST00000306026 SLC39A6Q13433 755 aa25■■□□□ 1.59
USP19-201ENST00000306026 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
USP19-201ENST00000306026 TTC5Q8N0Z6 440 aa25■■□□□ 1.59
USP19-201ENST00000306026 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
USP19-201ENST00000306026 TRIM27P14373 513 aa25■■□□□ 1.59
USP19-201ENST00000306026 ARHGAP45Q92619 1136 aa25■■□□□ 1.59
USP19-201ENST00000306026 WNK3Q9BYP7 1800 aa24.99■■□□□ 1.59
USP19-201ENST00000306026 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
USP19-201ENST00000306026 SLC4A2P04920 1241 aa24.98■■□□□ 1.59
USP19-201ENST00000306026 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa24.98■■□□□ 1.59
USP19-201ENST00000306026 TNNQ9UQP3 1299 aa24.98■■□□□ 1.59
USP19-201ENST00000306026 RLBP1P12271 317 aa24.97■■□□□ 1.59
USP19-201ENST00000306026 COG6Q9Y2V7 657 aa24.97■■□□□ 1.59
USP19-201ENST00000306026 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
USP19-201ENST00000306026 NECTIN2Q92692 538 aa24.96■■□□□ 1.59
USP19-201ENST00000306026 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.96■■□□□ 1.59
USP19-201ENST00000306026 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
USP19-201ENST00000306026 HEG1Q9ULI3 1381 aa24.95■■□□□ 1.59
USP19-201ENST00000306026 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
USP19-201ENST00000306026 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
USP19-201ENST00000306026 A0A0G2JS52 829 aa24.94■■□□□ 1.58
USP19-201ENST00000306026 MYT1Q01538 1121 aa24.94■■□□□ 1.58
USP19-201ENST00000306026 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.94■■□□□ 1.58
USP19-201ENST00000306026 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
USP19-201ENST00000306026 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.93■■□□□ 1.58
USP19-201ENST00000306026 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
USP19-201ENST00000306026 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.93■■□□□ 1.58
USP19-201ENST00000306026 PTPRCP08575 1304 aa24.93■■□□□ 1.58
USP19-201ENST00000306026 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
USP19-201ENST00000306026 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
USP19-201ENST00000306026 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
USP19-201ENST00000306026 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
USP19-201ENST00000306026 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.9■■□□□ 1.58
USP19-201ENST00000306026 PIGBQ92521 554 aa24.89■■□□□ 1.58
USP19-201ENST00000306026 ATRNO75882 1429 aa24.89■■□□□ 1.58
USP19-201ENST00000306026 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa24.88■■□□□ 1.57
USP19-201ENST00000306026 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.88■■□□□ 1.57
USP19-201ENST00000306026 G2E3Q7L622 706 aa24.88■■□□□ 1.57
USP19-201ENST00000306026 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
USP19-201ENST00000306026 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.88■■□□□ 1.57
USP19-201ENST00000306026 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.87■■□□□ 1.57
USP19-201ENST00000306026 AAMPQ13685 434 aa24.87■■□□□ 1.57
USP19-201ENST00000306026 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
USP19-201ENST00000306026 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.87■■□□□ 1.57
USP19-201ENST00000306026 ABCC4O15439 1325 aa24.87■■□□□ 1.57
USP19-201ENST00000306026 FLIIQ13045 1269 aa24.86■■□□□ 1.57
USP19-201ENST00000306026 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
USP19-201ENST00000306026 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
USP19-201ENST00000306026 BCL9O00512 1426 aa24.85■■□□□ 1.57
USP19-201ENST00000306026 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
USP19-201ENST00000306026 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
USP19-201ENST00000306026 FBXO41Q8TF61 875 aa24.84■■□□□ 1.57
USP19-201ENST00000306026 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.83■■□□□ 1.57
USP19-201ENST00000306026 GLI3P10071 1580 aa24.83■■□□□ 1.56
USP19-201ENST00000306026 ATG3Q9NT62 314 aa24.82■■□□□ 1.56
USP19-201ENST00000306026 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.82■■□□□ 1.56
USP19-201ENST00000306026 RGS12O14924 1447 aa24.81■■□□□ 1.56
USP19-201ENST00000306026 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
USP19-201ENST00000306026 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.9 ms