RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 NHSL1Q5SYE7 1610 aa28.71■■■□□ 2.19
VSTM4-201ENST00000298454 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa28.7■■■□□ 2.19
VSTM4-201ENST00000298454 FLIIQ13045 1269 aa28.69■■■□□ 2.18
VSTM4-201ENST00000298454 SIRT2Q8IXJ6 389 aa28.69■■■□□ 2.18
VSTM4-201ENST00000298454 SPG7Q9UQ90 795 aa28.69■■■□□ 2.18
VSTM4-201ENST00000298454 MSH5O43196 834 aa28.68■■■□□ 2.18
VSTM4-201ENST00000298454 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
VSTM4-201ENST00000298454 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.68■■■□□ 2.18
VSTM4-201ENST00000298454 PHKG2P15735 406 aa28.67■■■□□ 2.18
VSTM4-201ENST00000298454 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.67■■■□□ 2.18
VSTM4-201ENST00000298454 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
VSTM4-201ENST00000298454 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
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VSTM4-201ENST00000298454 ABCA3Q99758 1704 aa28.66■■■□□ 2.18
VSTM4-201ENST00000298454 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa28.66■■■□□ 2.18
VSTM4-201ENST00000298454 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
VSTM4-201ENST00000298454 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.65■■■□□ 2.18
VSTM4-201ENST00000298454 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
VSTM4-201ENST00000298454 MEIS3Q99687 375 aa28.64■■■□□ 2.18
VSTM4-201ENST00000298454 HOXB7P09629 217 aa28.64■■■□□ 2.17
VSTM4-201ENST00000298454 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.63■■■□□ 2.17
VSTM4-201ENST00000298454 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
VSTM4-201ENST00000298454 CCT4P50991 539 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
VSTM4-201ENST00000298454 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.62■■■□□ 2.17
VSTM4-201ENST00000298454 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
VSTM4-201ENST00000298454 CYP27B1O15528 508 aa28.61■■■□□ 2.17
VSTM4-201ENST00000298454 NUCB1Q02818 461 aa28.61■■■□□ 2.17
VSTM4-201ENST00000298454 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
VSTM4-201ENST00000298454 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.6■■■□□ 2.17
VSTM4-201ENST00000298454 GCC1Q96CN9 775 aa28.6■■■□□ 2.17
VSTM4-201ENST00000298454 SLC52A2Q9HAB3 445 aa28.6■■■□□ 2.17
VSTM4-201ENST00000298454 CHPF2Q9P2E5 772 aa28.6■■■□□ 2.17
VSTM4-201ENST00000298454 ATP10DQ9P241 1426 aa28.59■■■□□ 2.17
VSTM4-201ENST00000298454 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
VSTM4-201ENST00000298454 LNPKQ9C0E8 428 aa28.58■■■□□ 2.17
VSTM4-201ENST00000298454 HEG1Q9ULI3 1381 aa28.58■■■□□ 2.17
VSTM4-201ENST00000298454 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.58■■■□□ 2.16
VSTM4-201ENST00000298454 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.57■■■□□ 2.16
VSTM4-201ENST00000298454 SCN11AQ9UI33 1791 aa28.57■■■□□ 2.16
VSTM4-201ENST00000298454 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa28.57■■■□□ 2.16
VSTM4-201ENST00000298454 CHD1LQ86WJ1 897 aa28.57■■■□□ 2.16
VSTM4-201ENST00000298454 STRN4Q9NRL3 753 aa28.57■■■□□ 2.16
VSTM4-201ENST00000298454 CACNA1FO60840 1977 aa28.56■■■□□ 2.16
VSTM4-201ENST00000298454 CEP85Q6P2H3 762 aa28.56■■■□□ 2.16
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD44Q8N8A2 993 aa28.56■■■□□ 2.16
VSTM4-201ENST00000298454 SLC39A6Q13433 755 aa28.55■■■□□ 2.16
VSTM4-201ENST00000298454 ANKRD45Q5TZF3 282 aa28.55■■■□□ 2.16
VSTM4-201ENST00000298454 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa28.55■■■□□ 2.16
VSTM4-201ENST00000298454 DCAF5Q96JK2 942 aa28.55■■■□□ 2.16
VSTM4-201ENST00000298454 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.54■■■□□ 2.16
VSTM4-201ENST00000298454 ANXA1P04083 346 aa28.54■■■□□ 2.16
VSTM4-201ENST00000298454 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
VSTM4-201ENST00000298454 CHMP4AQ9BY43 222 aa28.54■■■□□ 2.16
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF790Q6PG37 636 aa28.54■■■□□ 2.16
VSTM4-201ENST00000298454 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
VSTM4-201ENST00000298454 EVA1CP58658 441 aa28.53■■■□□ 2.16
VSTM4-201ENST00000298454 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
VSTM4-201ENST00000298454 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.52■■■□□ 2.16
VSTM4-201ENST00000298454 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
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VSTM4-201ENST00000298454 PXDNLA1KZ92 1463 aa28.5■■■□□ 2.15
VSTM4-201ENST00000298454 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
VSTM4-201ENST00000298454 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
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VSTM4-201ENST00000298454 SEC24BO95487 1268 aa28.48■■■□□ 2.15
VSTM4-201ENST00000298454 IL2RBP14784 551 aa28.48■■■□□ 2.15
VSTM4-201ENST00000298454 PROSER3Q2NL68 480 aa28.48■■■□□ 2.15
VSTM4-201ENST00000298454 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.47■■■□□ 2.15
VSTM4-201ENST00000298454 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.47■■■□□ 2.15
VSTM4-201ENST00000298454 GNAI2P04899 355 aa28.47■■■□□ 2.15
VSTM4-201ENST00000298454 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
VSTM4-201ENST00000298454 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.46■■■□□ 2.15
VSTM4-201ENST00000298454 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.46■■■□□ 2.15
VSTM4-201ENST00000298454 GNAI3P08754 354 aa28.45■■■□□ 2.15
VSTM4-201ENST00000298454 CABP4P57796 275 aa28.45■■■□□ 2.15
VSTM4-201ENST00000298454 BTG4Q9NY30 223 aa28.45■■■□□ 2.15
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
VSTM4-201ENST00000298454 USP35Q9P2H5 1018 aa28.44■■■□□ 2.14
VSTM4-201ENST00000298454 DNAAF4Q8WXU2 420 aa28.44■■■□□ 2.14
VSTM4-201ENST00000298454 USP44Q9H0E7 712 aa28.44■■■□□ 2.14
VSTM4-201ENST00000298454 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
VSTM4-201ENST00000298454 ADCY9O60503 1353 aa28.43■■■□□ 2.14
VSTM4-201ENST00000298454 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa28.43■■■□□ 2.14
VSTM4-201ENST00000298454 TTC5Q8N0Z6 440 aa28.42■■■□□ 2.14
VSTM4-201ENST00000298454 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
VSTM4-201ENST00000298454 PDIA6Q15084 440 aa28.41■■■□□ 2.14
VSTM4-201ENST00000298454 BEND3Q5T5X7 828 aa28.41■■■□□ 2.14
VSTM4-201ENST00000298454 C5P01031 1676 aa28.4■■■□□ 2.14
VSTM4-201ENST00000298454 HMMRO75330 724 aa28.4■■■□□ 2.14
VSTM4-201ENST00000298454 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP28.4■■■□□ 2.14
VSTM4-201ENST00000298454 HYPKQ9NX55 129 aa28.4■■■□□ 2.14
VSTM4-201ENST00000298454 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
VSTM4-201ENST00000298454 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
VSTM4-201ENST00000298454 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 BCL11AQ9H165 835 aa28.38■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.37■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
VSTM4-201ENST00000298454 APBB1O00213 710 aa28.37■■■□□ 2.13
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