RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 SMC1BQ8NDV3 1235 aa11.04□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 NBPF4Q96M43 638 aa11.04□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF24Q5T7B8 1368 aa11.03□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP6V1AP38606 617 aa11.03□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 TMF1P82094 1093 aa11.03□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAPPC3LQ5T215 181 aa11.03□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 NMRK2Q9NPI5 230 aa11.03□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 TMOD3Q9NYL9 352 aa11.03□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 PARP3Q9Y6F1 533 aa11.03□□□□□ -0.64
PGGT1B-201ENST00000296642 NEUROD1Q13562 356 aa11.02□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 C9orf131Q5VYM1 1079 aa11.02□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 USHBP1Q8N6Y0 703 aa11.02□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 PIM2Q9P1W9 311 aa11.02□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 INSRP06213 1382 aa11.02□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 UBR3Q6ZT12 1888 aa11.01□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 FLT4P35916 1363 aa11.01□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 C10orf71Q711Q0 1435 aa11.01□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 PXDNLA1KZ92 1463 aa11□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0G2JLW4 131 aa11□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 RFC4P35249 363 aa11□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 PIGBQ92521 554 aa11□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 RGPD2P0DJD1 1756 aa10.99□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP27B1O15528 508 aa10.99□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00116Q8NCU8 138 aa10.99□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP10.99□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 DPEP1P16444 411 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 IFNL2Q8IZJ0 200 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 RRAGCQ9HB90 399 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF181Q9P0P0 153 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF13BQ9NQT8 1826 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 CDCA8Q53HL2 280 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 ITGB4P16144 1822 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 SIN3AQ96ST3 1273 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 GGNBP2Q9H3C7 697 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-201ENST00000296642 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 KCPQ6ZWJ8 1503 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 FYB1O15117 783 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 FBLN1P23142 703 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 HTRA3P83110 453 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 AMIGO3Q86WK7 504 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 DCAF5Q96JK2 942 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 TONSLQ96HA7 1378 aa10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS6KA4O75676 772 aa10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 ITPK1Q13572 414 aa10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 DPY19L2Q6NUT2 758 aa10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 ASAP1Q9ULH1 1129 aa10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 C4AP0C0L4 1744 aa10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 PKD1L3Q7Z443 1732 aa10.93□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa10.93□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 ERVV-2B6SEH9 535 aa10.93□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 GYS1P13807 737 aa10.93□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 POLA2Q14181 598 aa10.93□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 SMIM5Q71RC9 77 aa10.93□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 PHKG2P15735 406 aa10.92□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 LMNB1P20700 586 aa10.92□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 AIDAQ96BJ3 306 aa10.92□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 ATG3Q9NT62 314 aa10.92□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 GLTPD2A6NH11 291 aa10.91□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa10.9□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF831Q5JPB2 1677 aa10.9□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa10.9□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 ZPR1O75312 459 aa10.9□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 CABP4P57796 275 aa10.9□□□□□ -0.66
PGGT1B-201ENST00000296642 WASHC2AQ641Q2 1341 aa10.89□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNA3P22001 575 aa10.89□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 KDRP35968 1356 aa10.89□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF20BQ96Q89 1820 aa10.88□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 NCAPD2Q15021 1401 aa10.88□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 AMOTQ4VCS5 1084 aa10.88□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 TESK2Q96S53 571 aa10.88□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 PRDM10Q9NQV6 1147 aa10.88□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 CREBZFQ9NS37 354 aa10.88□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf141Q5JVX7 400 aa10.87□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 TTLL6Q8N841 843 aa10.87□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 EYA1Q99502 592 aa10.87□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa10.87□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa10.87□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 H0YIN7 160 aa10.86□□□□□ -0.67
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