RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.82■■□□□ 1.88
CXCL3-201ENST00000296026 UTRNP46939 3433 aa26.82■■□□□ 1.88
CXCL3-201ENST00000296026 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.81■■□□□ 1.88
CXCL3-201ENST00000296026 DCAF5Q96JK2 942 aa26.81■■□□□ 1.88
CXCL3-201ENST00000296026 GNPATO15228 680 aa26.8■■□□□ 1.88
CXCL3-201ENST00000296026 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.8■■□□□ 1.88
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
CXCL3-201ENST00000296026 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.8■■□□□ 1.88
CXCL3-201ENST00000296026 GRIN3BO60391 1043 aa26.79■■□□□ 1.88
CXCL3-201ENST00000296026 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
CXCL3-201ENST00000296026 KDRP35968 1356 aa26.77■■□□□ 1.88
CXCL3-201ENST00000296026 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.76■■□□□ 1.87
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CXCL3-201ENST00000296026 CABP4P57796 275 aa26.75■■□□□ 1.87
CXCL3-201ENST00000296026 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
CXCL3-201ENST00000296026 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.75■■□□□ 1.87
CXCL3-201ENST00000296026 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.75■■□□□ 1.87
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.74■■□□□ 1.87
CXCL3-201ENST00000296026 MTHFSP49914 203 aa26.74■■□□□ 1.87
CXCL3-201ENST00000296026 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.74■■□□□ 1.87
CXCL3-201ENST00000296026 IL13P35225 146 aa26.73■■□□□ 1.87
CXCL3-201ENST00000296026 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CXCL3-201ENST00000296026 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
CXCL3-201ENST00000296026 TRAPPC3LQ5T215 181 aa26.69■■□□□ 1.86
CXCL3-201ENST00000296026 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
CXCL3-201ENST00000296026 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.68■■□□□ 1.86
CXCL3-201ENST00000296026 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa26.67■■□□□ 1.86
CXCL3-201ENST00000296026 C1QTNF8P60827 252 aa26.67■■□□□ 1.86
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CXCL3-201ENST00000296026 MMP10P09238 476 aa26.66■■□□□ 1.86
CXCL3-201ENST00000296026 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
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CXCL3-201ENST00000296026 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
CXCL3-201ENST00000296026 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.65■■□□□ 1.86
CXCL3-201ENST00000296026 RPS6KA4O75676 772 aa26.64■■□□□ 1.86
CXCL3-201ENST00000296026 ADRA2BP18089 450 aa26.64■■□□□ 1.86
CXCL3-201ENST00000296026 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.63■■□□□ 1.85
CXCL3-201ENST00000296026 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CXCL3-201ENST00000296026 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
CXCL3-201ENST00000296026 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.63■■□□□ 1.85
CXCL3-201ENST00000296026 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.62■■□□□ 1.85
CXCL3-201ENST00000296026 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CXCL3-201ENST00000296026 HMOX1P09601 288 aa26.61■■□□□ 1.85
CXCL3-201ENST00000296026 RFC4P35249 363 aa26.61■■□□□ 1.85
CXCL3-201ENST00000296026 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
CXCL3-201ENST00000296026 GYS1P13807 737 aa26.59■■□□□ 1.85
CXCL3-201ENST00000296026 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
CXCL3-201ENST00000296026 ATP10DQ9P241 1426 aa26.58■■□□□ 1.85
CXCL3-201ENST00000296026 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.58■■□□□ 1.85
CXCL3-201ENST00000296026 LGR6Q9HBX8 967 aa26.58■■□□□ 1.85
CXCL3-201ENST00000296026 C4AP0C0L4 1744 aa26.58■■□□□ 1.85
CXCL3-201ENST00000296026 TJP1Q07157 1748 aa26.58■■□□□ 1.85
CXCL3-201ENST00000296026 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.58■■□□□ 1.84
CXCL3-201ENST00000296026 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
CXCL3-201ENST00000296026 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.57■■□□□ 1.84
CXCL3-201ENST00000296026 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.56■■□□□ 1.84
CXCL3-201ENST00000296026 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.54■■□□□ 1.84
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CXCL3-201ENST00000296026 TGFB2P61812 414 aa26.54■■□□□ 1.84
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.54■■□□□ 1.84
CXCL3-201ENST00000296026 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.54■■□□□ 1.84
CXCL3-201ENST00000296026 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.54■■□□□ 1.84
CXCL3-201ENST00000296026 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CXCL3-201ENST00000296026 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
CXCL3-201ENST00000296026 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CXCL3-201ENST00000296026 ADCY9O60503 1353 aa26.53■■□□□ 1.84
CXCL3-201ENST00000296026 MRC1P22897 1456 aa26.53■■□□□ 1.84
CXCL3-201ENST00000296026 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
CXCL3-201ENST00000296026 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
CXCL3-201ENST00000296026 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa26.52■■□□□ 1.84
CXCL3-201ENST00000296026 A0A0G2JLW4 131 aa26.51■■□□□ 1.83
CXCL3-201ENST00000296026 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
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CXCL3-201ENST00000296026 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
CXCL3-201ENST00000296026 SLC39A6Q13433 755 aa26.5■■□□□ 1.83
CXCL3-201ENST00000296026 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
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CXCL3-201ENST00000296026 FKBP8Q14318 412 aa26.48■■□□□ 1.83
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CXCL3-201ENST00000296026 BCS1LQ9Y276 419 aa26.48■■□□□ 1.83
CXCL3-201ENST00000296026 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CXCL3-201ENST00000296026 DPEP1P16444 411 aa26.47■■□□□ 1.83
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CXCL3-201ENST00000296026 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
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CXCL3-201ENST00000296026 DDR1Q08345 913 aa26.44■■□□□ 1.82
CXCL3-201ENST00000296026 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CXCL3-201ENST00000296026 ZPR1O75312 459 aa26.42■■□□□ 1.82
CXCL3-201ENST00000296026 FCHSD2O94868 740 aa26.42■■□□□ 1.82
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CXCL3-201ENST00000296026 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CXCL3-201ENST00000296026 KCNA3P22001 575 aa26.41■■□□□ 1.82
CXCL3-201ENST00000296026 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.41■■□□□ 1.82
CXCL3-201ENST00000296026 TM4SF1P30408 202 aa26.4■■□□□ 1.82
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.4■■□□□ 1.82
CXCL3-201ENST00000296026 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.4■■□□□ 1.82
CXCL3-201ENST00000296026 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.4■■□□□ 1.82
CXCL3-201ENST00000296026 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
CXCL3-201ENST00000296026 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.39■■□□□ 1.82
CXCL3-201ENST00000296026 COL15A1P39059 1388 aa26.38■■□□□ 1.81
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