RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295797.4

PRKCI-201, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCI, Length 4,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-201ENST00000295797 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa21.95■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.95■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 PLCD4Q9BRC7 762 aa21.95■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa21.95■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 DACH1Q9UI36 760 aa21.95■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.95■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.95■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 ADCY5O95622 1261 aa21.94■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.94■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 NOS1P29475 1434 aa21.94■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.94■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 SDSP20132 328 aa21.94■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 SPG7Q9UQ90 795 aa21.94■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 MCM5P33992 734 aa21.93■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 KIF18AQ8NI77 898 aa21.93■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.93■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 TXLNAP40222 546 aa21.92■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 ODF2Q5BJF6 829 aa21.92■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 RAB11FIP3O75154 756 aa21.92■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 SNX21Q969T3 373 aa21.92■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 TMX3Q96JJ7 454 aa21.92■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 IL16Q14005 1332 aa21.92■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 BTBD11A6QL63 1104 aa21.92■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC181Q5TID7 509 aa21.92■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.92■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.91■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.91■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.91■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 KRT32Q14532 448 aa21.91■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 MTMR7Q9Y216 660 aa21.91■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 GRIN2AQ12879 1464 aa21.91■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 LRSAM1Q6UWE0 723 aa21.91■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 DYNC1I1O14576 645 aa21.9■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 FAM193AP78312 1265 aa21.9■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.9■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.9■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.9■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa21.9■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 STX6O43752 255 aa21.89■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 SMTNL1A8MU46 457 aa21.89■■□□□ 1.1
PRKCI-201ENST00000295797 ERLIN2O94905 339 aa21.89■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa21.89■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.88■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 TNNT1P13805 278 aa21.88■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.88■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 MEIS3Q99687 375 aa21.88■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 NSD2O96028 1365 aa21.88■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 FAM177BA6PVY3 158 aa21.88■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 FLIIQ13045 1269 aa21.88■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 IDI1Q13907 227 aa21.88■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 CFAP100Q494V2 611 aa21.87■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 CENPHQ9H3R5 247 aa21.87■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa21.87■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.87■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 GJB2P29033 226 aa21.87■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 SMC5Q8IY18 1101 aa21.87■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.87■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 GBP3Q9H0R5 595 aa21.87■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 PTPRCP08575 1304 aa21.87■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.86■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 TRERF1Q96PN7 1200 aa21.86■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 GIMAP6Q6P9H5 292 aa21.86■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.85■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 URI1O94763 535 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 GUCY1B3Q02153 619 aa21.85■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 IQCEQ6IPM2 695 aa21.85■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.84■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 CRACR2AQ9BSW2 395 aa21.84■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 FBXO3Q9UK99 471 aa21.84■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.84■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 STIM1Q13586 685 aa21.84■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.84■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 USHBP1Q8N6Y0 703 aa21.83■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.83■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.83■■□□□ 1.09
PRKCI-201ENST00000295797 SPDYE4A6NLX3 237 aa21.83■■□□□ 1.08
PRKCI-201ENST00000295797 ZSCAN12O43309 604 aa21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms