RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291901.12

TNNT1-201, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNNT1, Length 967 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1-201ENST00000291901 GRIN3BO60391 1043 aa22.95■■□□□ 1.26
TNNT1-201ENST00000291901 SSFA2P28290 1259 aa22.95■■□□□ 1.26
TNNT1-201ENST00000291901 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TNNT1-201ENST00000291901 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.94■■□□□ 1.26
TNNT1-201ENST00000291901 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TNNT1-201ENST00000291901 DCAF5Q96JK2 942 aa22.92■■□□□ 1.26
TNNT1-201ENST00000291901 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.92■■□□□ 1.26
TNNT1-201ENST00000291901 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.91■■□□□ 1.26
TNNT1-201ENST00000291901 C1QTNF8P60827 252 aa22.91■■□□□ 1.26
TNNT1-201ENST00000291901 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.91■■□□□ 1.26
TNNT1-201ENST00000291901 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
TNNT1-201ENST00000291901 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TNNT1-201ENST00000291901 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TNNT1-201ENST00000291901 KDRP35968 1356 aa22.89■■□□□ 1.26
TNNT1-201ENST00000291901 CABP4P57796 275 aa22.89■■□□□ 1.25
TNNT1-201ENST00000291901 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.89■■□□□ 1.25
TNNT1-201ENST00000291901 MTHFSP49914 203 aa22.88■■□□□ 1.25
TNNT1-201ENST00000291901 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.88■■□□□ 1.25
TNNT1-201ENST00000291901 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.88■■□□□ 1.25
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.87■■□□□ 1.25
TNNT1-201ENST00000291901 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.87■■□□□ 1.25
TNNT1-201ENST00000291901 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TNNT1-201ENST00000291901 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.87■■□□□ 1.25
TNNT1-201ENST00000291901 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.86■■□□□ 1.25
TNNT1-201ENST00000291901 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
TNNT1-201ENST00000291901 MMP10P09238 476 aa22.85■■□□□ 1.25
TNNT1-201ENST00000291901 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
TNNT1-201ENST00000291901 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
TNNT1-201ENST00000291901 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.84■■□□□ 1.25
TNNT1-201ENST00000291901 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TNNT1-201ENST00000291901 IL13P35225 146 aa22.84■■□□□ 1.25
TNNT1-201ENST00000291901 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.84■■□□□ 1.25
TNNT1-201ENST00000291901 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.83■■□□□ 1.25
TNNT1-201ENST00000291901 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
TNNT1-201ENST00000291901 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TNNT1-201ENST00000291901 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TNNT1-201ENST00000291901 C4AP0C0L4 1744 aa22.82■■□□□ 1.24
TNNT1-201ENST00000291901 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TNNT1-201ENST00000291901 ATP10DQ9P241 1426 aa22.82■■□□□ 1.24
TNNT1-201ENST00000291901 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.81■■□□□ 1.24
TNNT1-201ENST00000291901 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
TNNT1-201ENST00000291901 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.8■■□□□ 1.24
TNNT1-201ENST00000291901 TJP1Q07157 1748 aa22.79■■□□□ 1.24
TNNT1-201ENST00000291901 RPS6KA4O75676 772 aa22.79■■□□□ 1.24
TNNT1-201ENST00000291901 RFC4P35249 363 aa22.79■■□□□ 1.24
TNNT1-201ENST00000291901 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
TNNT1-201ENST00000291901 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
TNNT1-201ENST00000291901 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.79■■□□□ 1.24
TNNT1-201ENST00000291901 HMOX1P09601 288 aa22.78■■□□□ 1.24
TNNT1-201ENST00000291901 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TNNT1-201ENST00000291901 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.78■■□□□ 1.24
TNNT1-201ENST00000291901 GYS1P13807 737 aa22.77■■□□□ 1.24
TNNT1-201ENST00000291901 A0A0G2JLW4 131 aa22.76■■□□□ 1.23
TNNT1-201ENST00000291901 ADRA2BP18089 450 aa22.76■■□□□ 1.23
TNNT1-201ENST00000291901 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TNNT1-201ENST00000291901 LGR6Q9HBX8 967 aa22.76■■□□□ 1.23
TNNT1-201ENST00000291901 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.76■■□□□ 1.23
TNNT1-201ENST00000291901 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.75■■□□□ 1.23
TNNT1-201ENST00000291901 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TNNT1-201ENST00000291901 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TNNT1-201ENST00000291901 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TNNT1-201ENST00000291901 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.73■■□□□ 1.23
TNNT1-201ENST00000291901 ADCY9O60503 1353 aa22.73■■□□□ 1.23
TNNT1-201ENST00000291901 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.72■■□□□ 1.23
TNNT1-201ENST00000291901 BCS1LQ9Y276 419 aa22.72■■□□□ 1.23
TNNT1-201ENST00000291901 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.72■■□□□ 1.23
TNNT1-201ENST00000291901 TGFB2P61812 414 aa22.71■■□□□ 1.23
TNNT1-201ENST00000291901 SLC39A6Q13433 755 aa22.71■■□□□ 1.23
TNNT1-201ENST00000291901 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.71■■□□□ 1.23
TNNT1-201ENST00000291901 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TNNT1-201ENST00000291901 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TNNT1-201ENST00000291901 DPEP1P16444 411 aa22.7■■□□□ 1.22
TNNT1-201ENST00000291901 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.7■■□□□ 1.22
TNNT1-201ENST00000291901 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TNNT1-201ENST00000291901 FKBP8Q14318 412 aa22.69■■□□□ 1.22
TNNT1-201ENST00000291901 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TNNT1-201ENST00000291901 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
TNNT1-201ENST00000291901 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.68■■□□□ 1.22
TNNT1-201ENST00000291901 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
TNNT1-201ENST00000291901 MRC1P22897 1456 aa22.66■■□□□ 1.22
TNNT1-201ENST00000291901 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.66■■□□□ 1.22
TNNT1-201ENST00000291901 FCHSD2O94868 740 aa22.65■■□□□ 1.22
TNNT1-201ENST00000291901 DDR1Q08345 913 aa22.65■■□□□ 1.22
TNNT1-201ENST00000291901 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.64■■□□□ 1.21
TNNT1-201ENST00000291901 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TNNT1-201ENST00000291901 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.64■■□□□ 1.21
TNNT1-201ENST00000291901 ZPR1O75312 459 aa22.63■■□□□ 1.21
TNNT1-201ENST00000291901 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
TNNT1-201ENST00000291901 KCNA3P22001 575 aa22.63■■□□□ 1.21
TNNT1-201ENST00000291901 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.63■■□□□ 1.21
TNNT1-201ENST00000291901 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TNNT1-201ENST00000291901 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.61■■□□□ 1.21
TNNT1-201ENST00000291901 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
TNNT1-201ENST00000291901 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
TNNT1-201ENST00000291901 CHRNA5P30532 468 aa22.6■■□□□ 1.21
TNNT1-201ENST00000291901 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.6■■□□□ 1.21
TNNT1-201ENST00000291901 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
TNNT1-201ENST00000291901 TM4SF1P30408 202 aa22.59■■□□□ 1.21
TNNT1-201ENST00000291901 PIM2Q9P1W9 311 aa22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms