RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
UBP1-201ENST00000283628 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP34.43■■■■□ 3.1
UBP1-201ENST00000283628 GNAI2P04899 355 aa34.43■■■■□ 3.1
UBP1-201ENST00000283628 EYA1Q99502 592 aa34.43■■■■□ 3.1
UBP1-201ENST00000283628 APBB1O00213 710 aa34.42■■■■□ 3.1
UBP1-201ENST00000283628 SLC4A10Q6U841 1118 aa34.42■■■■□ 3.1
UBP1-201ENST00000283628 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
UBP1-201ENST00000283628 CACNA1FO60840 1977 aa34.42■■■■□ 3.1
UBP1-201ENST00000283628 NWD1Q149M9 1564 aa34.42■■■■□ 3.1
UBP1-201ENST00000283628 ERC2O15083 957 aa34.42■■■■□ 3.1
UBP1-201ENST00000283628 BAG4O95429 457 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
UBP1-201ENST00000283628 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
UBP1-201ENST00000283628 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
UBP1-201ENST00000283628 F6X3S4 739 aa34.4■■■■□ 3.1
UBP1-201ENST00000283628 PDE1AP54750 535 aa34.4■■■■□ 3.1
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
UBP1-201ENST00000283628 KLHL40Q2TBA0 621 aa34.39■■■■□ 3.1
UBP1-201ENST00000283628 CCDC30Q5VVM6 783 aa34.38■■■■□ 3.09
UBP1-201ENST00000283628 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP34.37■■■■□ 3.09
UBP1-201ENST00000283628 GNAI3P08754 354 aa34.37■■■■□ 3.09
UBP1-201ENST00000283628 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa34.37■■■■□ 3.09
UBP1-201ENST00000283628 PHF8Q9UPP1 1060 aa34.37■■■■□ 3.09
UBP1-201ENST00000283628 BABAM1Q9NWV8 329 aa34.35■■■■□ 3.09
UBP1-201ENST00000283628 GNAT3A8MTJ3 354 aa34.35■■■■□ 3.09
UBP1-201ENST00000283628 GAS2L3Q86XJ1 694 aa34.35■■■■□ 3.09
UBP1-201ENST00000283628 FLIIQ13045 1269 aa34.34■■■■□ 3.09
UBP1-201ENST00000283628 PXDNLA1KZ92 1463 aa34.34■■■■□ 3.09
UBP1-201ENST00000283628 NLRP6P59044 892 aa34.34■■■■□ 3.09
UBP1-201ENST00000283628 SALL3Q9BXA9 1300 aa34.34■■■■□ 3.09
UBP1-201ENST00000283628 CLCN1P35523 988 aa34.33■■■■□ 3.09
UBP1-201ENST00000283628 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
UBP1-201ENST00000283628 AK9Q5TCS8 1911 aa34.32■■■■□ 3.09
UBP1-201ENST00000283628 LRRCC1Q9C099 1032 aa34.32■■■■□ 3.08
UBP1-201ENST00000283628 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
UBP1-201ENST00000283628 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
UBP1-201ENST00000283628 MAP3K5Q99683 1374 aa34.29■■■■□ 3.08
UBP1-201ENST00000283628 ATP8B2P98198 1209 aa34.29■■■■□ 3.08
UBP1-201ENST00000283628 HOXC9P31274 260 aa34.28■■■■□ 3.08
UBP1-201ENST00000283628 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa34.28■■■■□ 3.08
UBP1-201ENST00000283628 ABTB2Q8N961 1025 aa34.26■■■■□ 3.08
UBP1-201ENST00000283628 MX1P20591 662 aa34.26■■■■□ 3.07
UBP1-201ENST00000283628 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa34.26■■■■□ 3.07
UBP1-201ENST00000283628 MCM2P49736 904 aa34.24■■■■□ 3.07
UBP1-201ENST00000283628 MCTP1Q6DN14 999 aa34.24■■■■□ 3.07
UBP1-201ENST00000283628 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa34.24■■■■□ 3.07
UBP1-201ENST00000283628 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
UBP1-201ENST00000283628 STAP2Q9UGK3 403 aa34.23■■■■□ 3.07
UBP1-201ENST00000283628 NUTM2GQ5VZR2 741 aa34.23■■■■□ 3.07
UBP1-201ENST00000283628 MCCP23508 829 aa34.22■■■■□ 3.07
UBP1-201ENST00000283628 AOX1Q06278 1338 aa34.22■■■■□ 3.07
UBP1-201ENST00000283628 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa34.21■■■■□ 3.07
UBP1-201ENST00000283628 LMBRD1Q9NUN5 540 aa34.21■■■■□ 3.07
UBP1-201ENST00000283628 ANAPC15P60006 121 aa34.21■■■■□ 3.07
UBP1-201ENST00000283628 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.21■■■■□ 3.07
UBP1-201ENST00000283628 IL17REQ8NFR9 667 aa34.21■■■■□ 3.07
UBP1-201ENST00000283628 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
UBP1-201ENST00000283628 ZNF445P59923 1031 aa34.2■■■■□ 3.07
UBP1-201ENST00000283628 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
UBP1-201ENST00000283628 C14orf37Q86TY3 774 aa34.19■■■■□ 3.06
UBP1-201ENST00000283628 ESPNB1AK53 854 aa34.18■■■■□ 3.06
UBP1-201ENST00000283628 PKP1Q13835 747 aa34.18■■■■□ 3.06
UBP1-201ENST00000283628 CCDC173Q0VFZ6 552 aa34.18■■■■□ 3.06
UBP1-201ENST00000283628 IL17RAQ96F46 866 aa34.17■■■■□ 3.06
UBP1-201ENST00000283628 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
UBP1-201ENST00000283628 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
UBP1-201ENST00000283628 NFAT5O94916 1531 aa34.16■■■■□ 3.06
UBP1-201ENST00000283628 CHMLP26374 656 aa34.16■■■■□ 3.06
UBP1-201ENST00000283628 NEK4P51957 841 aa34.16■■■■□ 3.06
UBP1-201ENST00000283628 NASPP49321 788 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
UBP1-201ENST00000283628 USP44Q9H0E7 712 aa34.15■■■■□ 3.06
UBP1-201ENST00000283628 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
UBP1-201ENST00000283628 PSME1Q06323 249 aa34.15■■■■□ 3.06
UBP1-201ENST00000283628 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
UBP1-201ENST00000283628 NECTIN2Q92692 538 aa34.14■■■■□ 3.06
UBP1-201ENST00000283628 PPP1R9BQ96SB3 815 aa34.14■■■■□ 3.06
UBP1-201ENST00000283628 ZDHHC9Q9Y397 364 aa34.14■■■■□ 3.06
UBP1-201ENST00000283628 TSHZ3Q63HK5 1081 aa34.13■■■■□ 3.05
UBP1-201ENST00000283628 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
UBP1-201ENST00000283628 SSH3Q8TE77 659 aa34.13■■■■□ 3.05
UBP1-201ENST00000283628 TMX3Q96JJ7 454 aa34.13■■■■□ 3.05
UBP1-201ENST00000283628 LTN1O94822 1766 aa34.13■■■■□ 3.05
UBP1-201ENST00000283628 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa34.11■■■■□ 3.05
UBP1-201ENST00000283628 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa34.11■■■■□ 3.05
UBP1-201ENST00000283628 RAB11FIP3O75154 756 aa34.11■■■■□ 3.05
UBP1-201ENST00000283628 CUL4AQ13619 759 aa34.11■■■■□ 3.05
UBP1-201ENST00000283628 CHMP4AQ9BY43 222 aa34.11■■■■□ 3.05
UBP1-201ENST00000283628 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
UBP1-201ENST00000283628 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa34.1■■■■□ 3.05
UBP1-201ENST00000283628 RILPL2Q969X0 211 aa34.1■■■■□ 3.05
UBP1-201ENST00000283628 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa34.1■■■■□ 3.05
UBP1-201ENST00000283628 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
UBP1-201ENST00000283628 ORAI2Q96SN7 254 aa34.1■■■■□ 3.05
UBP1-201ENST00000283628 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP34.09■■■■□ 3.05
UBP1-201ENST00000283628 ANO2Q9NQ90 1003 aa34.08■■■■□ 3.05
UBP1-201ENST00000283628 KIF1AQ12756 1690 aa34.08■■■■□ 3.05
UBP1-201ENST00000283628 HOXB7P09629 217 aa34.07■■■■□ 3.04
UBP1-201ENST00000283628 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
UBP1-201ENST00000283628 NCLP19338 710 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
UBP1-201ENST00000283628 ERBB4Q15303 1308 aa34.06■■■■□ 3.04
UBP1-201ENST00000283628 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
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