RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258398.8

TTLL4-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TTLL4, Length 4,730 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL4-201ENST00000258398 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 VAMP4O75379 141 aa10.66□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 PLEKHG5O94827 1062 aa10.66□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 SMC2O95347 1197 aa10.66□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 GSDMDP57764 484 aa10.66□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 CCDC171Q6TFL3 1326 aa10.66□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 SMTNL1A8MU46 457 aa10.66□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 SRGAP3O43295 1099 aa10.66□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 PDE1AP54750 535 aa10.66□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 PTPN14Q15678 1187 aa10.66□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 FYB1O15117 783 aa10.66□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 KIF18AQ8NI77 898 aa10.66□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 ANO10Q9NW15 660 aa10.66□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 PREX2Q70Z35 1606 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 IQGAP3Q86VI3 1631 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 TUBB4AP04350 444 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 STK38Q15208 465 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 DACH1Q9UI36 760 aa10.65□□□□□ -0.7
TTLL4-201ENST00000258398 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa10.65□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa10.65□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 DMRT2Q9Y5R5 561 aa10.65□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 UNC13BO14795 1591 aa10.64□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa10.64□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 TTC5Q8N0Z6 440 aa10.64□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 FAM200AQ8TCP9 573 aa10.64□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa10.64□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 CCDC83Q8IWF9 413 aa10.64□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 NUTM2FA1L443 756 aa10.64□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 TNNT1P13805 278 aa10.64□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 CBX1P83916 185 aa10.64□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 AOX1Q06278 1338 aa10.64□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 MYO5CQ9NQX4 1742 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 RIC3Q7Z5B4 369 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 FEZ1Q99689 392 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 SHROOM2Q13796 1616 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 GNAT3A8MTJ3 354 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 CLIP2Q9UDT6 1046 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 ERVK-7P63135 1459 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 A0A1W2PP64 1363 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 PIK3R4Q99570 1358 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 ERLIN1O75477 346 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 CEP85Q6P2H3 762 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 LEKR1Q6ZMV7 388 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 RBSNQ9H1K0 784 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 ATP7AQ04656 1500 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 LMBRD1Q9NUN5 540 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa10.63□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 USP48Q86UV5 1035 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 PODXL2Q9NZ53 605 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 HMG20BQ9P0W2 317 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 ME1P48163 572 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 STX1AQ16623 288 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 MYRIPQ8NFW9 859 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 SSH2Q76I76 1423 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 CD109Q6YHK3 1445 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 WASLO00401 505 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 NLRP6P59044 892 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 AACSQ86V21 672 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 USP19O94966 1318 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 F13A1P00488 732 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 GJB2P29033 226 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 FLIIQ13045 1269 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 MPNDQ8N594 471 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 PIBF1Q8WXW3 757 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 SMARCE1Q969G3 411 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 EVI5LQ96CN4 794 aa10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP10.62□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 TRIM35Q9UPQ4 493 aa10.61□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP10.61□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 TMCO3Q6UWJ1 677 aa10.61□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 NUTM1Q86Y26 1132 aa10.61□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 UBXN4Q92575 508 aa10.61□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 ABCC1P33527 1531 aa10.61□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 ZSCAN12O43309 604 aa10.61□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 FILIP1LQ4L180 1135 aa10.6□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 MCM10Q7L590 875 aa10.6□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 ABCC4O15439 1325 aa10.6□□□□□ -0.71
TTLL4-201ENST00000258398 TXNDC2Q86VQ3 553 aa10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms