RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251303.10

SLX1A-201, Transcript of SLX1 homolog A, structure-specific endonuclease subunit, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLX1A, Length 1,091 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1A-201ENST00000251303 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa26.34■■□□□ 1.81
SLX1A-201ENST00000251303 POLKQ9UBT6 870 aa26.34■■□□□ 1.81
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.34■■□□□ 1.81
SLX1A-201ENST00000251303 KDRP35968 1356 aa26.33■■□□□ 1.81
SLX1A-201ENST00000251303 HSPA6P17066 643 aa26.33■■□□□ 1.81
SLX1A-201ENST00000251303 ATG3Q9NT62 314 aa26.33■■□□□ 1.81
SLX1A-201ENST00000251303 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.32■■□□□ 1.8
SLX1A-201ENST00000251303 MMP10P09238 476 aa26.3■■□□□ 1.8
SLX1A-201ENST00000251303 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
SLX1A-201ENST00000251303 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
SLX1A-201ENST00000251303 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
SLX1A-201ENST00000251303 KIF3CO14782 793 aa26.27■■□□□ 1.8
SLX1A-201ENST00000251303 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.27■■□□□ 1.8
SLX1A-201ENST00000251303 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.26■■□□□ 1.79
SLX1A-201ENST00000251303 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
SLX1A-201ENST00000251303 C4AP0C0L4 1744 aa26.25■■□□□ 1.79
SLX1A-201ENST00000251303 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.24■■□□□ 1.79
SLX1A-201ENST00000251303 TGFB2P61812 414 aa26.24■■□□□ 1.79
SLX1A-201ENST00000251303 TRAPPC3LQ5T215 181 aa26.24■■□□□ 1.79
SLX1A-201ENST00000251303 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.23■■□□□ 1.79
SLX1A-201ENST00000251303 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa26.22■■□□□ 1.79
SLX1A-201ENST00000251303 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SLX1A-201ENST00000251303 ADRA2BP18089 450 aa26.22■■□□□ 1.79
SLX1A-201ENST00000251303 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
SLX1A-201ENST00000251303 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SLX1A-201ENST00000251303 DCAF5Q96JK2 942 aa26.22■■□□□ 1.79
SLX1A-201ENST00000251303 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
SLX1A-201ENST00000251303 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
SLX1A-201ENST00000251303 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
SLX1A-201ENST00000251303 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
SLX1A-201ENST00000251303 A0A0G2JLW4 131 aa26.19■■□□□ 1.78
SLX1A-201ENST00000251303 GYS1P13807 737 aa26.19■■□□□ 1.78
SLX1A-201ENST00000251303 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.19■■□□□ 1.78
SLX1A-201ENST00000251303 BCS1LQ9Y276 419 aa26.19■■□□□ 1.78
SLX1A-201ENST00000251303 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
SLX1A-201ENST00000251303 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.18■■□□□ 1.78
SLX1A-201ENST00000251303 RPS6KA4O75676 772 aa26.17■■□□□ 1.78
SLX1A-201ENST00000251303 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SLX1A-201ENST00000251303 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.16■■□□□ 1.78
SLX1A-201ENST00000251303 DPEP1P16444 411 aa26.15■■□□□ 1.78
SLX1A-201ENST00000251303 RFC4P35249 363 aa26.15■■□□□ 1.78
SLX1A-201ENST00000251303 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
SLX1A-201ENST00000251303 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
SLX1A-201ENST00000251303 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.14■■□□□ 1.78
SLX1A-201ENST00000251303 CABP4P57796 275 aa26.14■■□□□ 1.78
SLX1A-201ENST00000251303 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.14■■□□□ 1.78
SLX1A-201ENST00000251303 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.13■■□□□ 1.77
SLX1A-201ENST00000251303 TJP1Q07157 1748 aa26.13■■□□□ 1.77
SLX1A-201ENST00000251303 TOMM70O94826 608 aa26.12■■□□□ 1.77
SLX1A-201ENST00000251303 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.12■■□□□ 1.77
SLX1A-201ENST00000251303 FCHSD2O94868 740 aa26.11■■□□□ 1.77
SLX1A-201ENST00000251303 APLP1P51693 650 aa26.11■■□□□ 1.77
SLX1A-201ENST00000251303 KCNA3P22001 575 aa26.1■■□□□ 1.77
SLX1A-201ENST00000251303 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
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SLX1A-201ENST00000251303 AEBP1Q8IUX7 1158 aa26.09■■□□□ 1.77
SLX1A-201ENST00000251303 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
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SLX1A-201ENST00000251303 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.08■■□□□ 1.77
SLX1A-201ENST00000251303 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.07■■□□□ 1.76
SLX1A-201ENST00000251303 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.07■■□□□ 1.76
SLX1A-201ENST00000251303 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
SLX1A-201ENST00000251303 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.06■■□□□ 1.76
SLX1A-201ENST00000251303 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SLX1A-201ENST00000251303 DDR1Q08345 913 aa26.04■■□□□ 1.76
SLX1A-201ENST00000251303 FKBP8Q14318 412 aa26.04■■□□□ 1.76
SLX1A-201ENST00000251303 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.04■■□□□ 1.76
SLX1A-201ENST00000251303 PIM2Q9P1W9 311 aa26.04■■□□□ 1.76
SLX1A-201ENST00000251303 WDR90Q96KV7 1748 aa26.04■■□□□ 1.76
SLX1A-201ENST00000251303 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.04■■□□□ 1.76
SLX1A-201ENST00000251303 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa26.03■■□□□ 1.76
SLX1A-201ENST00000251303 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.02■■□□□ 1.76
SLX1A-201ENST00000251303 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.75
SLX1A-201ENST00000251303 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
SLX1A-201ENST00000251303 MORC1Q86VD1 984 aa26.01■■□□□ 1.75
SLX1A-201ENST00000251303 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SLX1A-201ENST00000251303 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SLX1A-201ENST00000251303 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SLX1A-201ENST00000251303 KCPQ6ZWJ8 1503 aa25.99■■□□□ 1.75
SLX1A-201ENST00000251303 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SLX1A-201ENST00000251303 IL13P35225 146 aa25.98■■□□□ 1.75
SLX1A-201ENST00000251303 SBF1O95248 1867 aa25.98■■□□□ 1.75
SLX1A-201ENST00000251303 MRC1P22897 1456 aa25.98■■□□□ 1.75
SLX1A-201ENST00000251303 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SLX1A-201ENST00000251303 TM4SF1P30408 202 aa25.97■■□□□ 1.75
SLX1A-201ENST00000251303 CHRNA5P30532 468 aa25.97■■□□□ 1.75
SLX1A-201ENST00000251303 RNF181Q9P0P0 153 aa25.96■■□□□ 1.75
SLX1A-201ENST00000251303 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.75
SLX1A-201ENST00000251303 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
SLX1A-201ENST00000251303 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.95■■□□□ 1.75
SLX1A-201ENST00000251303 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.95■■□□□ 1.74
SLX1A-201ENST00000251303 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.95■■□□□ 1.74
SLX1A-201ENST00000251303 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SLX1A-201ENST00000251303 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.94■■□□□ 1.74
SLX1A-201ENST00000251303 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SLX1A-201ENST00000251303 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.94■■□□□ 1.74
SLX1A-201ENST00000251303 ZPR1O75312 459 aa25.93■■□□□ 1.74
SLX1A-201ENST00000251303 FSTL1Q12841 308 aa25.93■■□□□ 1.74
SLX1A-201ENST00000251303 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.93■■□□□ 1.74
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