RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
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TTL-201ENST00000233336 CCDC69A6NI79 296 aa11.9□□□□□ -0.5
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TTL-201ENST00000233336 NLRP6P59044 892 aa11.88□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 68.3
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TTL-201ENST00000233336 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 IQGAP2Q13576 1575 aa11.88□□□□□ -0.51
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TTL-201ENST00000233336 TANGO6Q9C0B7 1094 aa11.88□□□□□ -0.51
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TTL-201ENST00000233336 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 RAI14Q9P0K7 980 aa11.88□□□□□ -0.51
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TTL-201ENST00000233336 CCDC158Q5M9N0 1113 aa11.88□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 LMAN1P49257 510 aa11.88□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa11.88□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 STX6O43752 255 aa11.88□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 CDK19Q9BWU1 502 aa11.88□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 TMX1Q9H3N1 280 aa11.87□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 FCHSD2O94868 740 aa11.87□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 NUP133Q8WUM0 1156 aa11.87□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 CCDC171Q6TFL3 1326 aa11.86□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 TMC6Q7Z403 805 aa11.86□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.514e-6■■■■■ 29
TTL-201ENST00000233336 NLRP2Q9NX02 1062 aa11.86□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 CABP1Q9NZU7 370 aa11.86□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 RAB11FIP3O75154 756 aa11.86□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa11.86□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 KLHL10Q6JEL2 608 aa11.86□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 C8orf34Q49A92 452 aa11.86□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 DNAAF4Q8WXU2 420 aa11.86□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 KIF1BPQ96EK5 621 aa11.86□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 CTNNA3Q9UI47 895 aa11.86□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 KIF6Q6ZMV9 814 aa11.86□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 ZNF165P49910 485 aa11.85□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 FSIP1Q8NA03 581 aa11.85□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 TAF4BQ92750 862 aa11.85□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 POTEB2H3BUK9 544 aa11.85□□□□□ -0.51
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TTL-201ENST00000233336 NACAP1Q9BZK3 213 aa11.85□□□□□ -0.51
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TTL-201ENST00000233336 CNNM1Q9NRU3 951 aa11.85□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa11.85□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 GRIN2BQ13224 1484 aa11.85□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 CAVIN2O95810 425 aa11.85□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 GIMAP6Q6P9H5 292 aa11.85□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 SLC26A8Q96RN1 970 aa11.84□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 HS1BP3Q53T59 392 aa11.84□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 ANKRD62A6NC57 917 aa11.84□□□□□ -0.51
TTL-201ENST00000233336 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
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