RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 BCL11AQ9H165 835 aa23.48■■□□□ 1.35
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SIKE1-201ENST00000060969 MEGF6O75095 1541 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-201ENST00000060969 CPDO75976 1380 aa23.47■■□□□ 1.35
SIKE1-201ENST00000060969 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SIKE1-201ENST00000060969 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.46■■□□□ 1.35
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SIKE1-201ENST00000060969 MEIS3Q99687 375 aa23.43■■□□□ 1.34
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SIKE1-201ENST00000060969 ATP10DQ9P241 1426 aa23.4■■□□□ 1.34
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SIKE1-201ENST00000060969 PKD1L3Q7Z443 1732 aa23.33■■□□□ 1.33
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SIKE1-201ENST00000060969 ZNF790Q6PG37 636 aa23.28■■□□□ 1.32
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SIKE1-201ENST00000060969 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.24■■□□□ 1.31
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SIKE1-201ENST00000060969 USP44Q9H0E7 712 aa23.24■■□□□ 1.31
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SIKE1-201ENST00000060969 EVA1CP58658 441 aa23.22■■□□□ 1.31
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SIKE1-201ENST00000060969 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
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SIKE1-201ENST00000060969 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.2■■□□□ 1.31
SIKE1-201ENST00000060969 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.2■■□□□ 1.3
SIKE1-201ENST00000060969 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
SIKE1-201ENST00000060969 IL2RBP14784 551 aa23.2■■□□□ 1.3
SIKE1-201ENST00000060969 CABP4P57796 275 aa23.2■■□□□ 1.3
SIKE1-201ENST00000060969 BEND3Q5T5X7 828 aa23.2■■□□□ 1.3
SIKE1-201ENST00000060969 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SIKE1-201ENST00000060969 PDIA6Q15084 440 aa23.19■■□□□ 1.3
SIKE1-201ENST00000060969 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.19■■□□□ 1.3
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