RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000193170.1

Ccdc71-202, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Jdp2P97875 163 aa11.07□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 E2f5Q61502 335 aa11.07□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 ErfeQ6PGN1 340 aa11.07□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Htatsf1Q8BGC0 757 aa11.07□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Kif2cQ922S8 721 aa11.07□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Srpk2O54781 681 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cfap70D3YVL2 1141 aa11.06□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Nom1Q3UFM5 854 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Map3k20Q9ESL4 802 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa11.06□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa11.06□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Zmym3Q9JLM4 1370 aa11.06□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Zranb1Q7M760 708 aa11.06□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ankrd23Q812A3 306 aa11.06□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Wee1P47810 646 aa11.05□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 VdrP48281 422 aa11.05□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Paxip1Q6NZQ4 1056 aa11.05□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm156Q58A37 223 aa11.05□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ssh1Q76I79 1042 aa11.05□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Dmrtc1Q9D9R7 182 aa11.05□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 ChmQ9QXG2 665 aa11.05□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Adgrl3Q80TS3 1537 aa11.04□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Abcc6Q9R1S7 1498 aa11.04□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa11.04□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 RbsnQ80Y56 783 aa11.04□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Nutm1Q8BHP2 1126 aa11.04□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Q922C1 641 aa11.04□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Get4Q9D1H7 327 aa11.04□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Atg7Q9D906 698 aa11.04□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa11.04□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 F10O88947 481 aa11.04□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cep57l1Q8VDS7 400 aa11.04□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Rabep1O35551 862 aa11.03□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Nutm2Q3V0C3 733 aa11.03□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Aldh1l2Q8K009 923 aa11.03□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Raver1Q9CW46 748 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Klhl41A2AUC9 606 aa11.03□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Plekhd1B2RPU2 505 aa11.03□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Mcm4P49717 862 aa11.03□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ccdc181Q80ZU5 509 aa11.03□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Mast1Q9R1L5 1570 aa11.03□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Kif22Q3V300 660 aa11.03□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Kif3bQ61771 747 aa11.03□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 GsdmaQ9EST1 446 aa11.03□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Pola1P33609 1465 aa11.02□□□□□ -0.64
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cep63Q3UPP8 700 aa11.02□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ripor2Q80U16 1078 aa11.02□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Nop56Q9D6Z1 580 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 AI481877A2ALV5 1481 aa11.02□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Vps33bP59016 617 aa11.02□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Robo2Q7TPD3 1470 aa11.02□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Zcrb1Q9CZ96 217 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Stag1Q9D3E6 1258 aa11.01□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Kbtbd12Q9D618 625 aa11.01□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 PigoQ9JJI6 1093 aa11.01□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Arhgap4B1AUY3 965 aa11.01□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Terf2O35144 541 aa11.01□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ddit3P35639 168 aa11.01□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Dusp27Q148W8 1138 aa11.01□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Lrrc43Q3V0L5 667 aa11.01□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Bcl11bQ99PV8 884 aa11.01□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 NhsB1AV60 1647 aa11.01□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Igf1rQ60751 1373 aa11.01□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 BegainQ68EF6 600 aa11.01□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 CactinQ9CS00 772 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Pex14Q9R0A0 376 aa11.01□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa11□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 SelenovD3YXG1 328 aa11□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Timm44O35857 452 aa11□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Pde6bP23440 856 aa11□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Mta1Q8K4B0 715 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 CerkQ8K4Q7 531 aa11□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cyp2c50Q91X77 490 aa11□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Spata17Q9D552 379 aa11□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ttf2Q5NC05 1138 aa11□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cog6Q8R3I3 657 aa11□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Dhx8A2A4P0 1244 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ube4aE9Q735 1028 aa10.99□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Fam160a1Q505K2 1081 aa10.99□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Zcchc8Q9CYA6 709 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 IbtkQ6ZPR6 1352 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa10.99□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 ShprhQ7TPQ3 1674 aa10.99□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ifrd1P19182 449 aa10.98□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ovgp1Q62010 721 aa10.98□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Pick1Q62083 416 aa10.98□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Tsen2Q6P7W5 460 aa10.98□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Recql4Q75NR7 1216 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Nectin2P32507 530 aa10.98□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Nkx2-3P97334 362 aa10.98□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Tshz1Q5DTH5 1084 aa10.98□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Trmt6Q8CE96 497 aa10.98□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Add2Q9QYB8 725 aa10.98□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Myo3aQ8K3H5 1613 aa10.98□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 SlkO54988 1233 aa10.98□□□□□ -0.65
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cyp2c37P56654 490 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.9 ms