RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000046095.9

Vsx1-201, Transcript of Visual system homeobox 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vsx1, Length 3,791 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Skint5A7XUY5 1461 aa14.95□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ptch1Q61115 1434 aa14.95□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 R3hcc1Q8BSI6 488 aa14.95□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Il1rapl2Q9ERS6 686 aa14.95□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Abcc1O35379 1528 aa14.94□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rusc2Q80U22 1514 aa14.94□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa14.94□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Kif24Q6NWW5 1356 aa14.94□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Wdr78E9PYY5 807 aa14.94□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tsr2Q8C8T8 191 aa14.94□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Mknk2Q8CDB0 459 aa14.94□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tm6sf1P58749 370 aa14.94□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cers3Q1A3B0 383 aa14.94□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cchcr1Q8K2I2 770 aa14.94□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 MyclP10166 368 aa14.94□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Nol8Q3UHX0 1147 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Trim28Q62318 834 aa14.94□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Dennd6aQ8BH65 605 aa14.94□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Fam184aE9PW83 1143 aa14.93□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tmem132eQ6IEE6 982 aa14.93□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa14.93□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Med4Q9CQA5 270 aa14.93□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 PdcQ9QW08 244 aa14.93□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa14.93□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Mum1Q6DID5 682 aa14.93□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 HypkQ9CR41 129 aa14.93□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 NaspQ99MD9 773 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Bach2P97303 839 aa14.92□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Taf3Q5HZG4 932 aa14.92□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Sass6Q80UK7 654 aa14.92□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 EspnlQ3UYR4 1005 aa14.91□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Aldh1l2Q8K009 923 aa14.91□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Naip7Q9JIB3 1402 aa14.91□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ube2hP62257 183 aa14.91□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Strn4P58404 760 aa14.9□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Atp8b2P98199 1209 aa14.9□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Anp32cQ64G17 123 aa14.9□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Hook1Q8BIL5 728 aa14.9□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Polr3dQ91WD1 398 aa14.9□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ptgs1P22437 602 aa14.9□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Vwa3bJ9JI28 736 aa14.9□□□□□ -0.02
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Zkscan7E9PVW1 718 aa14.89□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cdkn1cP49919 348 aa14.89□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Usp25P57080 1055 aa14.89□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ano6Q6P9J9 911 aa14.89□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Dhx30Q99PU8 1217 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa14.89□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Slc26a8Q8R0C3 999 aa14.89□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Mmp8O70138 465 aa14.89□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Pde3bQ61409 1100 aa14.89□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ndufa8Q9DCJ5 172 aa14.89□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rbm42Q91V81 474 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Grpel1Q99LP6 217 aa14.88□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Iqsec2Q5DU25 1478 aa14.88□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Mcmdc2E9Q956 681 aa14.88□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Edc3Q8K2D3 508 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Q8C5K5 320 aa14.88□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Nop14Q8R3N1 860 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 U2af2P26369 475 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Syt1P46096 421 aa14.87□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rnf20Q5DTM8 973 aa14.87□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Chl1P70232 1209 aa14.87□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa14.86□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Anapc15P60007 132 aa14.86□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa14.86□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Gli2Q0VGT2 1544 aa14.86□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Eya1P97767 591 aa14.86□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Drc7Q6V3W6 876 aa14.86□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Tti2Q8BGV4 512 aa14.86□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ercc3P49135 783 aa14.86□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Hmgn5Q9JL35 406 aa14.86□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Krt85Q9Z2T6 507 aa14.86□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Uggt2E9Q4X2 1504 aa14.86□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 TatQ8QZR1 454 aa14.85□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ift57Q8BXG3 429 aa14.85□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Pnma3Q8JZW8 466 aa14.85□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cdca7lQ922M5 438 aa14.85□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 BccipQ9CWI3 316 aa14.85□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Ccdc94Q9D6J3 314 aa14.85□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Q3UJC8 639 aa14.84□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa14.84□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Zfp51Q3U4L8 781 aa14.84□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rbm8a2A0A0N4SUH6 174 aa14.84□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Rbm8aQ9CWZ3 174 aa14.84□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 Psma5Q9Z2U1 241 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Vsx1-201ENSMUST00000046095 ShprhQ7TPQ3 1674 aa14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.3 ms