Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PARP3Q9Y6F1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PARP3Q9Y6F1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms