Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARFGEF1Q9Y6D6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGEF1Q9Y6D6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGEF1Q9Y6D6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGEF1Q9Y6D6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGEF1Q9Y6D6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms