Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THRAP3Q9Y2W1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms