Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms