Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SHOC2Q9UQ13 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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