Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THSD7AQ9UPZ6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms