Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
INO80Q9ULG1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
INO80Q9ULG1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms