Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DNAJC28Q9NX36 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms