Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX1Q9NSU2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms