Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBP3Q9NS15 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBP3Q9NS15 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
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