Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB18Q9NP72 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB18Q9NP72 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms