Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TUBB2BQ9BVA1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms