Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAGR1Q9BTK6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAGR1Q9BTK6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms