Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARXQ96QS3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARXQ96QS3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms