Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGAP1Q96PV0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGAP1Q96PV0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms