Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD4Q96M96 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms