Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFAP53Q96M91 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFAP53Q96M91 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms