Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EP400Q96L91 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EP400Q96L91 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms