Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF1Q92879 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CELF1Q92879 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms