Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMO7Q8WWI1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO7Q8WWI1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms