Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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ZNF439Q8NDP4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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ZNF439Q8NDP4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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ZNF439Q8NDP4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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ZNF439Q8NDP4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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ZNF439Q8NDP4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF439Q8NDP4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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