Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTF1AQ7RTS3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms