Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
OTOP1Q7RTM1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms