Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EEF1DP3Q658K8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms