Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRAMEF6Q5VXH4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms