Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SUSD4Q5VX71 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SUSD4Q5VX71 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms