Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EFCAB2Q5VUJ9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EFCAB2Q5VUJ9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms