Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDLIM3Q53GG5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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