Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SVEP1Q4LDE5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms