Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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GEN1Q17RS7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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GEN1Q17RS7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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GEN1Q17RS7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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GEN1Q17RS7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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GEN1Q17RS7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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GEN1Q17RS7 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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GEN1Q17RS7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GEN1Q17RS7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GEN1Q17RS7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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