Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DUSP6Q16828 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DUSP6Q16828 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms