Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 FAM9B-203ENST00000428477 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 GIMAP7-201ENST00000313543 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 AL136115.1-201ENST00000447478 517 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
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FOXD1Q16676 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
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FOXD1Q16676 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
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FOXD1Q16676 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
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FOXD1Q16676 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
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FOXD1Q16676 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
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FOXD1Q16676 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
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FOXD1Q16676 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
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FOXD1Q16676 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXD1Q16676 AC097376.1-201ENST00000602907 997 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
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