Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LY6EQ16553 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms